الجواب و باللہ التوفیق

The ahadith mentioned in your question are considered Saheeh and acceptable from a chain of narration standpoint. Although the third narration is a mawqoof riwayat (i.e. a saying of Hazrat ‘Ayesha RaziAllah Ta‘ala ‘Anha), its correction has been mentioned in the references mentioned below.

In addition to mentioning the references for these ahadith, it seems important to also provide some clarifications. In the first hadith, the instruction that Rasulullah Sallallaho 'Alyhi Wasallam gave to the Sahabi, was not due to nahoosat, instead by living in that house there was a possibility of their beliefs getting corrupted, and there was a possibility that in times of hardship they may have associated the situation of deprivation towards the house. Therefore, in order to help them refrain from any trouble down the road, Rasulullah Sallallaho 'Alyhi Wasallam instructed him to change his house. In the third hadith of Rasulullah Sallallaho 'Alyhi Wasallam, there isn't a mention of drilling a hole in the illuminous grave of Rasulullah Sallallaho 'Alyhi Wasallam, rather it is mentioned to create a crack in the roof of rodha mubarak. Hazrat 'Ayesha Siddiqua RaziAllah Ta'ala 'Anha stated that a slight crack shall be made in the roof of the hujrah mubarakah of Rasulullah Sallallaho 'Alyhi Wasallam so that there is no curtain between the sky and rodha mubarak. It does not mean that naudhubillah the illuminated face of Rasulullah Sallallaho 'Alyhi Wasallam shall be made to face the sky. The references for the ahadith mentioned in your question are as follows:

عنْ جَابِرٍ أَنَّ النَّبِىَّ -صلى الله عليه وسلم- رَأَى امْرَأَةً فَدَخَلَ عَلَى زَيْنَبَ بِنْتِ جَحْشٍ فَقَضَى حَاجَتَهُ مِنْهَا ثُمَّ خَرَجَ إِلَى أَصْحَابِهِ فَقَالَ لَهُمْ « إِنَّ الْمَرْأَةَ تُقْبِلُ فِى صُورَةِ شَيْطَانٍ فَمَنْ وَجَدَ مِنْ ذَلِكَ شَيْئًا فَلْيَأْتِ أَهْلَهُ فَإِنَّهُ يُضْمِرُ مَا فِى نَفْسِهِ ».(صحیح مسلم،کتاب النکاح،۳۴۷۳۔سنن ابو داود:کتاب النکاح،۲۱۵۳۔سنن ترمذی:النکاح،۱۱۵۸)

عَنْ أَنَسِ بْنِ مَالِكٍ قَالَ قَالَ رَجُلٌ يَا رَسُولَ اللَّهِ إِنَّا كُنَّا فِى دَارٍ كَثِيرٌ فِيهَا عَدَدُنَا وَكَثِيرٌ فِيهَا أَمْوَالُنَا فَتَحَوَّلْنَا إِلَى دَارٍ أُخْرَى فَقَلَّ فِيهَا عَدَدُنَا وَقَلَّتْ فِيهَا أَمْوَالُنَا. فَقَالَ رَسُولُ اللَّهِ -صلى الله عليه وسلم- « ذَرُوهَا ذَمِيمَةً ».(سنن ابی داود:کتاب الطب،باب فِى الطِّيَرَةِ۳۹۲۶)

فأمرهم بالتحول عنها ، لأنهم كانوا فيها على استثقال لظلها ، واستيحاش ،فأمرهم بالانتقال ليزول عنهم ما يجدون من الكراهية ، لا أنها سبب في ذلك.(ءشرح السنۃ:۱۲/۱۷۹)

أي اتركوها مذمومة فعيلة بمعنى مفعولة قاله بن الأثير والمعنى اتركوها بالتحول عنها حال كونها مذمومة لأن هواءها غير موافق لكم قال الأردبيلي في الأزهار أي ذروها وتحولوا عنها لتخلصوا عن سوء الظن ورؤية البلاء من نزول تلك الدار انتهی ۔

قال الخطابي وبن الأثير إنما أمرهم بالتحول عنها إبطالا لما وقع في نفوسهم من أن المكروه إنما أصابهم بسبب السكنى فإذا تحولوا عنها انقطعت مادة ذلك الوهم وزال عنهم ما خامرهم من الشبهة انتهى والحديث سكت عنه المنذري (عون المعبود۱۰/۳۰۰۰)

وفي الدار التحول منها لأنه متى استمر فيها ربما حمله ذلك على اعتقاد صحة الطيرة والتشاؤم وعليه ينزل قول الإمام لما سئل عن الحديث كم من دار سكنها ناس فهلكوا وقد أخرجه أبو داود وصححه الحاكم عن أنس قال رجل : يا رسول الله إنا كنا في دار كثر فيها عددنا ومالنا فتحولنا إلى أخرى فقل فيها ذلك فقال : ذروها ذميمة.۔(فیض القدیر :۴/۳۸۹)

حدثنا أبو الجوزاء أوس بن عبد الله قال : قحط أهل المدينة قحطا شديدا فشكوا إلى عائشة فقالت انظروا قبر النبي صلى الله عليه و سلم فاجعلوا منه كووا إلى السماء حتى لا يكون بينه وبين السماء سقف قال ففعلوا فمطرنا مطرا حتى نبت العشب وسمنت الإبل حتى تفتقت من الشحم فسمي عام الفتق ۔قال حسين سليم أسد : رجاله ثقات وهو موقوف على عائشة سنن دارمي :92رقم:۹۲-إتحاف المهرة بالفوائد المبتكرة من أطراف العشرة:لابن حجر عسقلانی: 21606.۔

قحط أهل المدينة على بناء المفعول قحطا شديدا فشكوا أي الناس إلى عائشة فقالت انظروا قبر النبي بالنصب على نزع الخافض وفي نسخة إلى قبر النبي فاجعلوا منه أي من قبره كوى بفتح الكاف ويضم ففي المغرب الكوة نقب البيت والجمع كوى وقد يضم الكاف في المفرد والجمع اه وقيل يجمع على كوى بالكسر والقصر والمد أيضا والكوة بالضم ويجمع على كوى بالضم والمعنى اجعلوا من مقابلة قبره في سقف حجرته منافذ متعددة حتى لا يكون بينه أي بين قبره وبين السماء سفق أي حجاب ظاهري ففعلوا فمطروا بضم فكسر مطراأي شديدا حتى نبت العشب بضم فسكون أي العلف في منابته وسمنت بكسر الميم الإبل وكذا سائر المواشي بالأولى حتى تفتقت أي انتفخت خواصرها من الرعي وقيل انشقت وقيل اتسعت من الشحم أي من كثرته فسمي عام الفتق أي سنة الخصب الذي أفضى إلى الفتق هذا وقد قيل في سيب كشف قبر النبي أن السماء لما رأت قبر النبي سال الوادي من بكائها قال تعالى فما بكت عليهم السماء والأرض الدخان حكاية عن حال الكفار فيكون أمرها على خلاف ذلك بالنسبة إلى الأبرار وقيل إنه كان يستشفع به عند الجدب فتمطر السماء فأمرت عائشة رضي الله عنها بكشف قبره مبالغة في الاستشفاع به فلا يبقى بينه وبين السماء حجاب أقول وكأنه كناية عن عرض الغرض المطلوب بتوجهه إلى السماء وهي قبلة الدعاء ومحل رزق الضعفاء كما قال تعالى وفي السماء رزقكم(مرقاۃ المفاتیحح:۱۷/۲۲۷)

فقط واللہ اعلم بالصواب